El Instituto de Altos Estudios Diplomáticos Pedro Gual está compuesto por un Consejo Superior y un Consejo Académico. El Consejo Superior es la máxima autoridad de esta institución y está integrado por el Ministro o la Ministra del Poder Popular para Relaciones Exteriores, quien lo preside; la Directora o Director General del Instituto; un representante del Consejo Nacional de Universidades y tres miembros designados por el MPPRE que representen al sector académico y diplomático.
Al Consejo Superior le corresponde establecer la política general del Instituto de acuerdo a los lineamientos establecidos por el MPPRE y el Consejo Nacional de Universidades; dictar su Reglamento Interno; crear, modificar, fusionar o suprimir unidades organizativas de rango inferior a las Coordinaciones y revisar las decisiones del Consejo Académico.
Por su parte, el Consejo Académico es el responsable, entre otros, de hacer cumplir los lineamientos de política institucional fijados por el Consejo Superior; proponer y dirigir la normativa académica y administrativa del Instituto; elaborar los planes anuales de actividades docentes, de investigación y extensión; autorizar el establecimiento de convenios interinstitucionales de cooperación con otros institutos de Educación Superior, venezolanos o extranjeros; evaluar las solicitudes de equivalencia y reconocimiento de créditos obtenidos en cursos de postgrado dictados en otros Centros de Estudio y autorizar el nombramiento, remoción, traslado o contratación del personal del IAEDPG.
